{"id":1579,"date":"2024-11-19T10:23:15","date_gmt":"2024-11-19T16:23:15","guid":{"rendered":"https:\/\/stacatarina.mx\/consejos\/abordar-la-perdida-de-biodiversidad-con-secuenciacion-genomica\/"},"modified":"2024-11-19T10:23:15","modified_gmt":"2024-11-19T16:23:15","slug":"abordar-la-perdida-de-biodiversidad-con-secuenciacion-genomica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/stacatarina.mx\/consejos\/abordar-la-perdida-de-biodiversidad-con-secuenciacion-genomica\/","title":{"rendered":"Abordar la p\u00e9rdida de biodiversidad con secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica"},"content":{"rendered":"
\n

Neil Ward, vicepresidente de PacBio EMEA<\/em><\/p>\n

La p\u00e9rdida de biodiversidad en el Reino Unido actualmente est\u00e1 superando los esfuerzos de conservaci\u00f3n para abordarla, con casi 1 de cada 6 especies en riesgo de extinci\u00f3n. De hecho, desde 1970, la abundancia de especies prioritarias del Reino Unido ha disminuido en un 60%, lo que lo convierte en el peor de los pa\u00edses del G7.<\/p>\n

Proteger la biodiversidad de Gran Breta\u00f1a es una parte clave de El Departamento de Medio Ambiente, Alimentaci\u00f3n y Asuntos Rurales anunci\u00f3 recientemente prioridades de pol\u00edtica ambiental bajo el nuevo gobierno del Reino Unido. Las cinco prioridades van desde limpiar las v\u00edas fluviales hasta aumentar la seguridad alimentaria, pero quiz\u00e1s el objetivo m\u00e1s ambicioso sea “garantizar la recuperaci\u00f3n de la naturaleza”. Lograr este objetivo requiere conocimientos a nivel molecular de la biolog\u00eda de los organismos, tanto plantas como animales. Para lograr este punto de vista, la secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica debe aplicarse en la investigaci\u00f3n de la biodiversidad. La secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica completa y precisa permite a los cient\u00edficos profundizar en la salud de las especies y la din\u00e1mica poblacional para informar las estrategias de conservaci\u00f3n.<\/p>\n

Secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica para descubrir amenazas a la vida silvestre<\/strong><\/p>\n

La creaci\u00f3n de la imagen m\u00e1s precisa y completa de la biolog\u00eda subyacente de un organismo se basa en un m\u00e9todo conocido como secuenciaci\u00f3n del genoma completo (WGS). Los enfoques tradicionales de WGS, llamados lecturas cortas, dividen el genoma de un organismo en peque\u00f1os fragmentos para secuenciarlos y luego los reconstruyen para construir una imagen hol\u00edstica de su ADN. Pero este m\u00e9todo de lectura breve tiene dificultades para capturar partes m\u00e1s largas y complejas del genoma que son especialmente importantes en la investigaci\u00f3n de plantas y animales. Por ejemplo, el genoma del trigo es cinco veces m\u00e1s largo que el genoma humano, lo que supone una gran cantidad de c\u00f3digo gen\u00f3mico que hay que reconstruir sin errores ni lagunas.<\/p>\n

Por el contrario, una forma m\u00e1s avanzada de secuenciaci\u00f3n del genoma completo, llamada secuenciaci\u00f3n de lectura larga, puede procesar segmentos de ADN mucho m\u00e1s grandes. Esto permite a los investigadores capturar el genoma de un organismo de forma precisa y completa. Una vez que el ADN de un organismo ha sido completamente decodificado, hay varias formas en que los datos gen\u00f3micos se pueden aplicar en la conservaci\u00f3n:<\/p>\n

    \n
  1. Captura y catalogaci\u00f3n<\/strong> \u2013 El primer paso en muchos proyectos de investigaci\u00f3n de biodiversidad basados \u200b\u200ben la gen\u00f3mica es la construcci\u00f3n de genomas de referencia. Los genomas de referencia son secuencias de ADN destinadas a servir como ejemplos representativos de la composici\u00f3n gen\u00e9tica de una especie. Proporcionan un est\u00e1ndar para comparar con muestras de ADN individuales recolectadas durante la investigaci\u00f3n de una poblaci\u00f3n local en particular. Al catalogar especies utilizando genomas de referencia, los investigadores pueden comprender c\u00f3mo funcionan los ecosistemas y localizar cualquier dependencia. <\/li>\n
  2. Identificar rasgos para la adaptaci\u00f3n.<\/strong> \u2013 Los genomas de referencia ayudan a responder preguntas cruciales sobre c\u00f3mo est\u00e1n evolucionando las especies, mostrando qu\u00e9 genes tienen m\u00e1s probabilidades de causar cambios f\u00edsicos y qu\u00e9 variaciones gen\u00e9ticas son m\u00e1s dominantes. Por ejemplo, \u00bfpor qu\u00e9 los pandas gigantes son m\u00e1s susceptibles a la baja fertilidad y por qu\u00e9 los leones son m\u00e1s vulnerables al VIF? Estos conocimientos pueden ayudar a fundamentar los programas de mejoramiento, al identificar plantas y animales con adaptaciones m\u00e1s favorables.<\/li>\n
  3. Diversidad de poblaci\u00f3n<\/strong> \u2013 Las poblaciones con alta diversidad gen\u00e9tica tienen m\u00e1s probabilidades de sobrevivir a nuevas condiciones ambientales, mientras que las especies con baja diversidad gen\u00e9tica tienen menos probabilidades de adaptarse, lo que aumenta el riesgo de extinci\u00f3n. El an\u00e1lisis de la variaci\u00f3n gen\u00e9tica a lo largo del tiempo puede indicar cu\u00e1ndo una especie est\u00e1 en riesgo de disminuir en un lugar determinado, lo que brinda a los cient\u00edficos la oportunidad de intervenir y prevenir extinciones.<\/li>\n<\/ol>\n

    Secuenciando la vida silvestre del Reino Unido con el \u00c1rbol de la Vida de Darwin<\/strong><\/p>\n

    El proyecto Darwin Tree of Life (DToL) es un ejemplo de c\u00f3mo el Reino Unido est\u00e1 trabajando para abordar la p\u00e9rdida de biodiversidad, restaurar la naturaleza brit\u00e1nica y ayudar a los programas de conservaci\u00f3n. El proyecto DToL tiene como objetivo secuenciar gen\u00e9ticamente las 70.000 especies de las Islas Brit\u00e1nicas, contribuyendo as\u00ed al Proyecto BioGenoma de la Tierra. Hasta noviembre de 2023, el DToL ha publicado m\u00e1s de 1000 conjuntos de genomas con calidad de referencia en bases de datos p\u00fablicas, listos para ser utilizados por investigadores de todo el mundo. Como:<\/p>\n

      \n
    • Abejorro <\/strong>\u2013 Entre el 85% y el 95% de los cultivos polinizados por insectos del Reino Unido dependen de polinizadores silvestres, pero las poblaciones de abejorros est\u00e1n amenazadas a nivel mundial. Con genomas de abejorros de alta calidad, los investigadores pueden identificar partes del genoma que son importantes para la salud de las poblaciones contempor\u00e1neas, lo que puede contribuir a los esfuerzos de conservaci\u00f3n. <\/li>\n
    • Sapo <\/strong>\u2013 Las poblaciones brit\u00e1nicas del sapo com\u00fan han disminuido dr\u00e1sticamente, y ciertas enfermedades han acabado con poblaciones reproductoras locales enteras. Utilizando la gen\u00f3mica, los investigadores pueden identificar genes espec\u00edficos de resistencia a enfermedades, lo que puede dirigir programas de mejoramiento y minimizar el riesgo de extinci\u00f3n.<\/li>\n
    • manzano <\/strong>\u2013 Gran Breta\u00f1a e Irlanda cuentan con unas 2.500 variedades locales de manzanas comestibles, un tercio de las aproximadamente 7.500 que se encuentran en todo el mundo. Con secuencias de m\u00e1s de 40 manzanos, los investigadores pueden identificar rasgos gen\u00e9ticos que tienen m\u00e1s probabilidades de sobrevivir a nuevas condiciones ambientales, como el aumento de temperaturas y las sequ\u00edas, y generar los mayores rendimientos. <\/li>\n<\/ul>\n

      Hacer realidad la promesa de la gen\u00f3mica de la biodiversidad <\/strong><\/p>\n

      El proyecto Darwin Tree of Life es una de las muchas asociaciones de colaboraci\u00f3n que transforman la forma en que el Reino Unido lleva a cabo la investigaci\u00f3n y conservaci\u00f3n de la biodiversidad, pero el trabajo no ha terminado. S\u00f3lo se han secuenciado 900 de las 450.000 especies de plantas estimadas en la Tierra, mientras que el 0,2% de las especies animales tener una secuencia del genoma disponible p\u00fablicamente. Debe haber una mayor inversi\u00f3n global en proyectos de gen\u00f3mica de la biodiversidad como el DToL y en la \u00faltima tecnolog\u00eda de secuenciaci\u00f3n para impulsar avances en las pol\u00edticas de conservaci\u00f3n y proteger el ecosistema de la Tierra.<\/p>\n<\/p><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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